《明日传奇第二季》中，传奇小队依旧肩负着守护时间线的重任。队员包括原子侠雷·帕尔默、火风暴组合（马丁·斯坦因和杰斐逊·杰克逊）、鹰女夏拉、鹰侠卡特·霍尔、白幽灵米克·罗里等。他们遭遇了新的强大敌人汪达尔·萨维奇的余党，以及时间变异管理局的干涉。在一次行动中，小队穿越到不同的历史时期，如古埃及、西部荒野等，期间引发了一系列混乱。火风暴组合内部产生矛盾，杰斐逊对马丁的控制方式不满，两人的关系变得紧张。而米克在经历了一系列事件后，逐渐从自私的罪犯转变为有担当的团队成员。小队还结识了新伙伴，如扎丽·泰勒。他们在一次次冒险中不断磨合，共同对抗威胁时间线的邪恶势力，努力让历史回归正轨。