《童话镇第三季》延续奇幻风格，主角艾玛带着亨利回到童话镇，却发现这里被冰雪皇后搅得天翻地覆。冰雪皇后为报复，给小镇带来无尽寒冬。与此同时，虎克船长为了爱情追随艾玛来到这里，和她的感情在冒险中逐渐升温。 故事主线交织着多条童话线索，白雪公主与王子努力守护小镇，对抗冰雪皇后的邪恶力量；瑞金娜则在善恶之间徘徊，一方面想弥补过去的过错，一方面又受黑暗力量的诱惑。关键转折在于，众人发现要破除冰雪皇后的魔法，需要集齐三把魔法钥匙。在寻找钥匙的过程中，各个角色的秘密被揭开，他们的身世和过往经历也逐渐清晰。最终，在大家的共同努力下，冰雪皇后的阴谋被粉碎，童话镇恢复往日生机，而艾玛等人的感情也在这场冒险中得到升华。