《命运航班第三季》延续前作神秘风格。蒙特哥航空828号航班消失五年后又奇迹回归，乘客们归来后拥有了“感召力”，能预见未来、感知危险。第三季里，本·斯通继续带领乘客们探寻“感召力”背后的真相。在这过程中，乘客们面临着外界的猜疑与调查，政府机构对他们严密监控，试图揭开其中奥秘。而乘客内部也出现分歧，有人因“感召力”带来的压力而崩溃。同时，新的危机不断涌现，一次“感召”预示着巨大灾难，本和米凯拉等核心人物必须争分夺秒，既要躲避外界追捕又要解开谜团拯救众人。此外，乘客们的个人生活也受到影响，感情、家庭关系在重重压力下发生变化。他们在命运的漩涡中挣扎前行，努力掌握自己的命运。